MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Calothrix sp. PCC 7507 chromosome

Total Repeats: 137003

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019682	GCA	2	6	20	25	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_019682	GGT	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019682	AAC	2	6	153	158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715355
4	NC_019682	GTA	2	6	234	239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
5	NC_019682	TGA	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
6	NC_019682	ACGA	2	8	310	317	50 %	0 %	25 %	25 %	427715355
7	NC_019682	ATC	2	6	335	340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715355
8	NC_019682	ATC	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715355
9	NC_019682	A	6	6	379	384	100 %	0 %	0 %	0 %	427715355
10	NC_019682	AG	3	6	486	491	50 %	0 %	50 %	0 %	427715355
11	NC_019682	TGG	2	6	512	517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715355
12	NC_019682	AGC	2	6	680	685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
13	NC_019682	TGT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715355
14	NC_019682	TGA	2	6	701	706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715355
15	NC_019682	AAG	2	6	739	744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715355
16	NC_019682	T	6	6	747	752	0 %	100 %	0 %	0 %	427715355
17	NC_019682	GTT	2	6	789	794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715355
18	NC_019682	A	6	6	921	926	100 %	0 %	0 %	0 %	427715355
19	NC_019682	GTGAT	2	10	955	964	20 %	40 %	40 %	0 %	427715355
20	NC_019682	GCC	2	6	1091	1096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715355
21	NC_019682	AGC	2	6	1109	1114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
22	NC_019682	CGA	3	9	1188	1196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715355
23	NC_019682	GA	3	6	1195	1200	50 %	0 %	50 %	0 %	427715355
24	NC_019682	GTAT	2	8	1222	1229	25 %	50 %	25 %	0 %	427715355
25	NC_019682	GAA	2	6	1272	1277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715355
26	NC_019682	GGT	2	6	1281	1286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715355
27	NC_019682	AAT	2	6	1411	1416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715355
28	NC_019682	AGC	2	6	1431	1436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_019682	TA	3	6	1442	1447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019682	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_019682	GTG	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019682	GGTAGA	2	12	1698	1709	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019682	TAAT	2	8	1737	1744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019682	GC	3	6	1859	1864	0 %	0 %	50 %	50 %	427715356
35	NC_019682	CGAC	2	8	1915	1922	25 %	0 %	25 %	50 %	427715356
36	NC_019682	GAT	2	6	2116	2121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715356
37	NC_019682	TGG	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715356
38	NC_019682	GC	3	6	2202	2207	0 %	0 %	50 %	50 %	427715356
39	NC_019682	AAC	2	6	2268	2273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715356
40	NC_019682	AGC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715356
41	NC_019682	TTGA	2	8	2281	2288	25 %	50 %	25 %	0 %	427715356
42	NC_019682	CTA	2	6	2312	2317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715356
43	NC_019682	AGT	2	6	2412	2417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715356
44	NC_019682	GGT	4	12	2443	2454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715356
45	NC_019682	CCAG	2	8	2473	2480	25 %	0 %	25 %	50 %	427715356
46	NC_019682	AGA	2	6	2723	2728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427715356
47	NC_019682	ATA	2	6	2729	2734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715356
48	NC_019682	CAA	2	6	2764	2769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715356
49	NC_019682	AAT	2	6	3049	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019682	AAT	2	6	3060	3065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_019682	CTC	2	6	3117	3122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_019682	CAA	2	6	3170	3175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_019682	A	6	6	3182	3187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019682	AGC	2	6	3242	3247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_019682	TAT	2	6	3258	3263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_019682	AACT	2	8	3284	3291	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_019682	TCT	2	6	3333	3338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
58	NC_019682	AGCA	2	8	3385	3392	50 %	0 %	25 %	25 %	427715357
59	NC_019682	GTA	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
60	NC_019682	CAA	2	6	3513	3518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
61	NC_019682	GTT	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427715357
62	NC_019682	CGT	2	6	3602	3607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715357
63	NC_019682	TCT	2	6	3608	3613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
64	NC_019682	CTT	2	6	3616	3621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715357
65	NC_019682	TAG	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
66	NC_019682	GTA	2	6	3693	3698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
67	NC_019682	GCA	2	6	3716	3721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
68	NC_019682	ATT	2	6	3723	3728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715357
69	NC_019682	TTTA	2	8	3812	3819	25 %	75 %	0 %	0 %	427715357
70	NC_019682	GTG	2	6	3888	3893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
71	NC_019682	AGT	2	6	3935	3940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
72	NC_019682	TAC	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715357
73	NC_019682	CAA	2	6	4013	4018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
74	NC_019682	AACCG	2	10	4066	4075	40 %	0 %	20 %	40 %	427715357
75	NC_019682	TGG	2	6	4111	4116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
76	NC_019682	CAA	2	6	4212	4217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715357
77	NC_019682	GGC	2	6	4452	4457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427715357
78	NC_019682	TGA	2	6	4607	4612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
79	NC_019682	TGG	2	6	4658	4663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
80	NC_019682	GAC	2	6	4689	4694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
81	NC_019682	TGA	2	6	4808	4813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715357
82	NC_019682	ACC	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
83	NC_019682	CCA	2	6	4870	4875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
84	NC_019682	CCAGT	2	10	4974	4983	20 %	20 %	20 %	40 %	427715357
85	NC_019682	AGC	2	6	4989	4994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715357
86	NC_019682	ACC	2	6	5051	5056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715357
87	NC_019682	GGT	2	6	5076	5081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715357
88	NC_019682	TAT	2	6	5188	5193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715357
89	NC_019682	ACCTA	2	10	5451	5460	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_019682	GAT	2	6	5603	5608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019682	CTCA	2	8	5683	5690	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_019682	CT	3	6	5708	5713	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_019682	GGT	2	6	5738	5743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715358
94	NC_019682	TCA	2	6	5803	5808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715358
95	NC_019682	AGG	2	6	5820	5825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715358
96	NC_019682	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
97	NC_019682	AACG	2	8	5843	5850	50 %	0 %	25 %	25 %	427715358
98	NC_019682	ACA	2	6	5857	5862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715358
99	NC_019682	GTGA	2	8	5945	5952	25 %	25 %	50 %	0 %	427715358
100	NC_019682	T	6	6	5954	5959	0 %	100 %	0 %	0 %	427715358
101	NC_019682	CGC	3	9	6082	6090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715358
102	NC_019682	GTA	2	6	6098	6103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
103	NC_019682	AAT	2	6	6107	6112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
104	NC_019682	TGC	2	6	6117	6122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
105	NC_019682	ATA	2	6	6141	6146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
106	NC_019682	TCC	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715358
107	NC_019682	AGG	2	6	6168	6173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427715358
108	NC_019682	TAG	2	6	6211	6216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
109	NC_019682	A	6	6	6384	6389	100 %	0 %	0 %	0 %	427715358
110	NC_019682	C	6	6	6396	6401	0 %	0 %	0 %	100 %	427715358
111	NC_019682	TGC	2	6	6424	6429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
112	NC_019682	TCAA	2	8	6432	6439	50 %	25 %	0 %	25 %	427715358
113	NC_019682	CAC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427715358
114	NC_019682	CA	3	6	6554	6559	50 %	0 %	0 %	50 %	427715358
115	NC_019682	CAT	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427715358
116	NC_019682	GTG	2	6	6702	6707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427715358
117	NC_019682	CCAG	2	8	6765	6772	25 %	0 %	25 %	50 %	427715358
118	NC_019682	ACG	2	6	6904	6909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715358
119	NC_019682	TCG	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715358
120	NC_019682	ATA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
121	NC_019682	AAT	2	6	6971	6976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715358
122	NC_019682	TTC	2	6	7009	7014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715358
123	NC_019682	TCT	2	6	7082	7087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427715358
124	NC_019682	GCC	2	6	7120	7125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427715358
125	NC_019682	CACCAG	2	12	7146	7157	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	427715358
126	NC_019682	A	6	6	7166	7171	100 %	0 %	0 %	0 %	427715358
127	NC_019682	TCC	2	6	7177	7182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715358
128	NC_019682	AGT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
129	NC_019682	TGA	2	6	7201	7206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427715358
130	NC_019682	ATT	2	6	7255	7260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427715358
131	NC_019682	ACAT	2	8	7386	7393	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_019682	ACCCC	2	10	7397	7406	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
133	NC_019682	CA	3	6	7447	7452	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_019682	AC	3	6	7482	7487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_019682	TTCGTT	2	12	7510	7521	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_019682	TG	3	6	7679	7684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_019682	AGGGG	2	10	7703	7712	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_019682	CA	3	6	7818	7823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_019682	ATT	2	6	7839	7844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_019682	TAC	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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151	NC_019682	TAA	3	9	8124	8132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_019682	GTA	2	6	13617	13622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_019682	AAT	2	6	14373	14378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427715367
271	NC_019682	GAC	2	6	14403	14408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715367
272	NC_019682	CTG	2	6	14539	14544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715367
273	NC_019682	TA	4	8	14572	14579	50 %	50 %	0 %	0 %	427715367
274	NC_019682	GCA	2	6	14645	14650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715367
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288	NC_019682	TGG	2	6	15592	15597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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299	NC_019682	GTT	2	6	16256	16261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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373	NC_019682	GTA	2	6	19604	19609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
374	NC_019682	ACT	2	6	19655	19660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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376	NC_019682	GCAA	2	8	19717	19724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
377	NC_019682	TGA	3	9	19735	19743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
378	NC_019682	TCT	2	6	19819	19824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
379	NC_019682	TAC	2	6	19828	19833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
380	NC_019682	ATTT	2	8	19895	19902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
381	NC_019682	A	7	7	19909	19915	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
382	NC_019682	TAA	2	6	19941	19946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_019682	TGC	2	6	19974	19979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_019682	CTT	2	6	19983	19988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
385	NC_019682	CAAT	2	8	20029	20036	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
386	NC_019682	A	6	6	20067	20072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
387	NC_019682	ATA	2	6	20140	20145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
388	NC_019682	TGTT	2	8	20197	20204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
389	NC_019682	CTA	2	6	20212	20217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
390	NC_019682	A	8	8	20240	20247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_019682	TA	3	6	20270	20275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_019682	A	6	6	20327	20332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_019682	T	6	6	20405	20410	0 %	100 %	0 %	0 %	427715370
394	NC_019682	TGCT	2	8	20499	20506	0 %	50 %	25 %	25 %	427715370
395	NC_019682	CAA	2	6	20618	20623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715370
396	NC_019682	CCT	2	6	20798	20803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715370
397	NC_019682	A	6	6	20962	20967	100 %	0 %	0 %	0 %	427715370
398	NC_019682	AGC	2	6	21003	21008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427715370
399	NC_019682	CAAATG	2	12	21012	21023	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	427715370
400	NC_019682	TAAAT	2	10	21055	21064	60 %	40 %	0 %	0 %	427715370
401	NC_019682	CTC	2	6	21065	21070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	427715370
402	NC_019682	AAC	2	6	21097	21102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427715370
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429	NC_019682	GTCT	2	8	22693	22700	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
430	NC_019682	AC	3	6	22824	22829	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
431	NC_019682	TAT	2	6	22897	22902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
432	NC_019682	T	6	6	23029	23034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_019682	AGAT	2	8	23115	23122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
434	NC_019682	A	6	6	23177	23182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
435	NC_019682	TA	3	6	23231	23236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_019682	ATTA	2	8	24080	24087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_019682	A	6	6	24105	24110	100 %	0 %	0 %	0 %	427715373
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496	NC_019682	GAT	2	6	26209	26214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
497	NC_019682	TA	3	6	26247	26252	50 %	50 %	0 %	0 %	427715375
498	NC_019682	CTG	2	6	26260	26265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427715375
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